遺伝子クローニングにかかる費用【実験にはお金がかかる】④

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遺伝子クローニングにかかる費用を計算してみた

こんにちは.

博士号を取得後,派遣社員として基礎研究に従事しているフールです.

趣味で研究を展開できる,純粋に好奇心を追求できる,そんな「自分だけの研究施設」を作るには,いくらぐらい必要なのでしょうか?

それを考えるために,日々の実験業務にかかる費用を考えています!

本記事では,遺伝子クローニングにかかる費用を計算*してみました

あなたは,遺伝子クローニングに,どのくらい費用がかかると思いますか?

*ココで使用している数値は,定価・希望小売価格・オープン価格・参考小売価格のどれかです.私の職場が実際に支払っている価格ではありません.

 

サマリー・約1,000円が,PCRの1回のお値段です.
・約360円が,PCR産物の精製にかかる費用です.
・約7,100円が,クローニングとトランスフォーメーションにかかる費用です.
・約1,400円が,コロニーPCRの1回分のお値段です.
・約2,400円が,ミニプレップとシークエンスにかかる費用です.

遺伝子クローニングのプロトコール

私が行っている遺伝子クローニングのプロトコールは,以下通りです.

  • RNA抽出キットの説明書に従ってRNAを抽出する
  • RNA濃度を測定する
  • cDNA合成キットの説明書に従ってcDNA合成を行う
  • PCRキットの説明書に従ってPCRをかける
  • 電気泳動で目的サイズの断片が増幅されているか確認する
  • 増幅産物を切り出す
  • 増幅産物を精製する
  • 精製物を遺伝子クローニングキットでクローニングする
  • クローニング産物を大腸菌にトランスフォーメーションする
  • 大腸菌のコロニーが生えたことを確認する
  • コロニーPCRでクローニング産物の有無を確認する
  • クローニング産物をもった大腸菌を少量培養する
  • ミニプレップ(プラスミド抽出)する
  • シークエンスでクローニング産物の配列を確認する

遺伝子クローニングと一言で済むことですが,実際はかなりのステップがありますね!

色々なキットも使っているので,費用もそれなりにかかりそうですね…

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遺伝子クローニングにかかる費用

上記プロトコールで,私が使用する材料とその費用*は以下の通りです.

RNA抽出およびcDNA合成に掛かる費用に関しては,前回の記事をご覧ください.

それでは本題です.

先ずは最後に1回のPCRにかかるお値段です↓

材料など販売価格(¥)1回あたりの費用(¥)
PCRキット30,000150
アガロース26,000260
TAE26,50053
ローディングバッファー12,0001.2
サイズマーカー17,000170
染色剤26,000130
小計137,500764.2
チップ・ピペット類15,700114.5
チューブ類26,40026.4
小計42,100140.85
合計179,600905
合計(税込)197,560995.56

PCRの1回分のお値段は,約1,000円ということが分かりました!

続いて,切り出し精製にかかる費用です↓

材料など販売価格(¥)1回あたりの費用(¥)
精製キット14,000280
チューブ類4,2004.2
チップ・ピペット類28,20040.93
合計46,400325
合計(税込)51,040357.6

PCR産物の精製にかかる費用は,約360円でした.

次に,クローニングとトランスフォーメーションに掛かるお値段です↓

材料など販売価格(¥)1回あたりの費用(¥)
クローニングキット38,3003,830
チューブ類26,40026.4
チップ・ピペット類28,20032.9
合計92,9003,889
合計(税込)102,1904,278.2
材料など販売価格(¥)1回あたりの費用(¥)
コンピテントセル21,0002,100
LBプレート3,900390
LB(粉末)9,0000.72
チューブ類4,2004.2
チップ・ピペット類28,20032.9
コンラージ棒21,25021.25
合計87,5502,549.07
合計(税込)96,3052,803.98

クローニング自体にかかる費用は約4,300円で,それを大腸菌にトランスフォーメーションするお値段は約2,800円でした.

今度は,コロニーPCRに掛かる費用を考えてみましょう↓

材料など販売価格(¥)1回あたりの費用(¥)
PCRキット9,000113
アガロース26,000260
TAE26,50053
ローディングバッファー12,0001.2
サイズマーカー17,000170
染色剤26,000130
LBプレート3,900390
Nuclease free water620.0155
小計120,4621,117
チップ・ピペット類15,700114.5
チューブ類26,40026.4
つまようじ2150.43
小計42,315141.28
合計162,7771,258
合計(税込)179,054.701,384.35

コロニーPCRにかかる費用は,約1,400円でした.

最後に,ミニプレップとシークエンスに掛かるお値段です↓

材料など販売価格(¥)1回あたりの費用(¥)
抽出キット18,000360
LB(粉末)9,0000.72
蒸留水6210.85
抗生物質350070
小計30,562442
チップ・ピペット類15,700114.5
チューブ類48,70093.2
つまようじ2150.43
小計64,615208.08
合計95,177650
合計(税込)104,694.70714.62
材料など販売価格(¥)1回あたりの費用(¥)
シークエンスキット5,050,0001,010
99.5%エタノール2,260316.4
ホルムアミド7,0005.6
0.5 M EDTA12,0000.006
3 M 酢酸ナトリウム(pH5.2)8,0000.16
Nuclease free water620.016
小計5,079,3221,332
チップ・ピペット類15,700114.5
チューブ類26,40026.4
つまようじ2150.43
小計42,315141
合計5,121,6371,473
合計(税込)5,633,800.71,620.81

ミニプレップにかかる費用は約720円で,抽出したプラスミドのシークエンス費用は約1,620円でした.

以上より,遺伝子クローニングにかかる費用は,約14,600円*くらいだと推測できます(RNA抽出やcDNA合成にかかる費用も含みます).

結構なお値段ですね(笑).

これは1サンプル分ですから,標的遺伝子が増えてサンプル数が増えるほど,その費用も増えるってことですね…

*濃度測定に掛かる費用(機器代・チップ代など)やプライマー代は含んでいません.

遺伝子クローニングにかかる費用【1か月分】

次に遺伝子クローニングかかる費用を1か月あたりに換算します.

でも,遺伝子クローニングなんて頻繁にはやりません(笑).

だから仮のお話とします.

もし私が,1か月で4回の遺伝子クローニングを行ったら,どのくらいかかるのでしょうか?

単純計算で,14,600 × 4 ≒ 58,300円

ただ,サンプルとなるRNAは同一の物を使用すると考えた場合,お値段は少し安くなって約51,100円です(笑).

考慮すべきその他の費用

遺伝子クローニングかかる費用を計算してきました.

ただ,材料だけそろえても実験はできません.

実験装置を整える必要があります.

今回の計算には,ピペッター・遠心機・泳動装置・シークエンス機器・パソコンなどの機器類の費用を考慮していません

毎度のことですが,これらは,1回分という計算ができないので除外しています.

1度そろえれば長期使用可能なので,初期費用という計算になるのでしょう.

いつか,機器類に関して計算してみようと考えています.

ただ,シークエンス機器は1000万円越えだと聞いたことがあるので,あんまり考えたくありません(笑).

遺伝子クローニングかかる費用【まとめ】

実験にかかる費用として,遺伝子クローニングかかる費用を計算してみました.

いかがでしたでしょうか?

1回のクローニング作業で15,000円も使っていましたね.

全て1回で上手くいった場合のお値段ですので,もしココにプライマーの複数設計やPCRの条件検討などを加わった場合は,もっと高くなりますね!

いままでは労力だけを考えてました.

でも今回,お金と労力をかけてクローニングしていることがわかりました.

お金と労力をかけてクローニングした遺伝子の機能が…だとモチベーションは下がり放しです(笑).

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最後までお付き合いいただきありがとうございました.

次回もよろしくお願いいたします.

2020年9月14日 フール