ゲル電気泳動の通電条件【どの泳動条件が良いの？】
結局，どの通電条件が良いの？
本記事は，このような「なぜ？どうして？」にお答えします．
こんにちは．
博士号を取得後，派遣社員として基礎研究に従事しているフールです．
前々回と前回で，ゲル電気泳動の通電条件について説明してきました．
「結局，どの通電条件が良いの？」というイライラも高まってきたことと思います（笑）．
お待たせしました！！
本記事では，ゲル電気泳動の通電条件の使い分けについて，より具体的にまとめています．
ただし，私の経験に基づく【まとめ】なので，絶対ではありません．
サマリー・サブマリン型電気泳動装置では，定電圧設定で行います．
・PAGEは，定電流設定で行うことが多いです．
・ゲルの数が多いときや複数の泳動装置を使用するときは，定電圧設定にします．
通電条件を決める2つの原則
「電流（A）は通電面積に比例する．」
「電圧（V）は電極間の距離に比例する．」
上記は，通電条件を決めるときに重要な原則です．
通電面積とは，ゲルの大きさ・厚さ・枚数・緩衝液の体積のことです．
例えば，ゲルの厚さが２倍なったら，電流を２倍にします．
また，ゲルの枚数が2枚になっても，電流を２倍にします．
電極間の距離とは，泳動距離のことです．
泳動装置が大きくなると，泳動距離も長くなるので，高電圧の電源が必要になります．
サブマリン型電気泳動装置なら【定電圧】
アガロースゲル電気泳動の泳動装置は，サブマリン型ですね．
アガロースゲルを作るときを思い出してみてください．
ゲルの厚さを整えたことありますか？
泳動するときを思い出してみてください．
泳動槽のバッファーの量を毎回そろえていますか？
ゲルの厚さやバッファー量を几帳面にそろえている方もいるかもしれません．
でも，なんとなくの感覚で行っている方が大半ではないでしょうか？
ゲルの厚さや緩衝液の体積は，通電面積に関わります．
通電面積の条件を統一していないので，定電流設定の泳動条件では，測定間再現性が得られない可能性があります．
なお，再現性については，以下の記事でまとめています．
定電圧であれば，通電面積を気にする必要はありませんね！
同じ泳動装置を使い続ける限り，泳動距離も同じなので電極間の距離も気にする必要はありません．
PAGEでは【定電流】
現在のポリアクリルアミドゲルは，たとえお手製のゲルであっても，ゲルの厚さを整えることは簡単になりました．
泳動バッファーの体積も整えることが可能です．
泳動条件が整っているので，時間を節約するという意味でも，定電流での泳動をオススメします．
ただし，前回の記事にまとめたように，発熱の問題があります．
熱の影響でサンプルが拡散・分解・不活性化などが生じることは忘れないようにしましょう．
【定電圧】設定でPAGEをするとき
定電流をオススメしましたが，もちろん，定電圧設定で泳動することもあります．
私は，以下のような場合に定電圧で PAGE を行います．
・ゲルの枚数が2枚以上のとき．
・１台の電源に泳動槽を2~4台つなぐとき．
・高分子側の解像度をキレイにしたいとき．
ゲルの枚数が2枚以上のとき
泳動槽にもよりますが， 4 枚のゲルを一つの泳動槽で処理することができます．
定電流設定では，ゲルの枚数 × 電流値で電流量を変える必要があります．
最初から高電流にする必要があるため，発熱量が大きいことが想定されます．
発熱による悪影響が，より一層高まる可能性があるので，私は定電圧にします．
１台の電源に泳動槽を2-4台つなぐとき
電源内部は並列回路です．
直列回路ではありません．
1 台の電源に複数台の泳動槽をつなぐとき，並列回路では台数 × 電流値で電流量を変える必要があります．
やはり，最初から高電流にする必要があるため，発熱量が大きいことが想定されます．
発熱による悪影響が，より一層高まる可能性があるので，私は定電圧にします．
高分子側の解像度をキレイにしたいとき
定電流では，高分子側の移動が遅く，低分子側の移動が速いです．
よって，定電流設定では，どうしても高分子側の解像度が落ちてしまいます．
目的分子が高分子で，且つ，バンドの濃さを定量する実験系では，私は定電圧にします．
以上，ゲル電気泳動の通電条件の使い分けでした．
最後までお付き合いいただきありがとうございました．
次回もよろしくお願いいたします．
2020年2月13日 フール
